Różne źródła podają różne daty powstania klubu w Ajaccio, jednak są to lata 1909 - 1910. Nowa drużyna przyjęła stroje w czerwone i białe paski. Na początku grali oni na boisku piaszczystym, jednak później przenieśli się na inny, czystszy i bezpieczniejszy stadion pod zarządztwem Jeana Louisa, teścia prezesa klubu Louisa Barettiego. Nowy stadion posiadał 5.000 miejsc i był używany do 1969 roku.

AC Ajaccio byli piłkarskimi mistrzami Korsyki ośmiokrotnie. Są oni jedną z trzech wielkich drużyn wyspiarskich, razem z SC Bastia oraz Gazélec Ajaccio. Rywalizacja pomiędzy tymi trzema drużynami oraz ich kibicami nie jest tajemnicą. Podczas finału Pucharu Korsyki w 1946 roku kibice musieli bronić się przed przemocą za pomocą parasolek. Po rzucie karnym przyznanym drużynie z Ajaccio wybuchły zamieszki, których główną bronią były właśnie parasole. Mecz został przerwany i rozegrany w późniejszym terminie.

Ajaccio stał się profesjonalnym klubem w 1965 roku dzięki ambitnej postawie liderów drużyny. Nowym herbem zespołu stał się w tamtych czasach niedźwiedź polarny, jednak nieco później zmieniono go na bardziej tradycyjne logo, nawiązujące do herbu Korsyki.

• 6. miejsce w Ligue 1: 1971
• 2 razy mistrz Ligue 2: 1967, 2002
• 8 razy mistrz Korsyki: 1920, 1921, 1934, 1939, 1948, 1950, 1955, 1964, 1994